| 會(huì)議日期 | 2020-12-10至 2020-12-13 |
| 會(huì)議地點(diǎn) | 江蘇南京 |
| 會(huì)議學(xué)科 | 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)生物學(xué) |
| 主辦單位 | 中科成創(chuàng)（北京）生物技術(shù)有限公司 |
| 學(xué)分情況 | 無(wú) |
關(guān)于舉辦“10X Genomics單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及多組學(xué)數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)培訓(xùn)班”通知
各有關(guān)單位:
隨著新一代單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的快速發(fā)展，在準(zhǔn)確度大大提高的前提下, 進(jìn)一步降低測(cè)序成本。由此不斷產(chǎn)生出巨量的分子生物學(xué)數(shù)據(jù)，這些數(shù)據(jù)有著數(shù)量巨大、關(guān)系復(fù)雜的特點(diǎn)，以至于不利用計(jì)算機(jī)根本無(wú)法實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)和分析。隨著生物信息學(xué)作為新興學(xué)科迅速蓬勃發(fā)展，正在改變?nèi)藗冄芯可镝t(yī)學(xué)的傳統(tǒng)方式，單細(xì)胞技術(shù)以及數(shù)據(jù)分析技術(shù)已成為探索生物學(xué)底層機(jī)制和研究人類(lèi)復(fù)雜疾病診斷、治療及預(yù)后的重要工具，廣泛應(yīng)用于生命科學(xué)各個(gè)領(lǐng)域，是21世紀(jì)生命科學(xué)與生物技術(shù)的重要戰(zhàn)略前沿和主要突破口。為進(jìn)一步推動(dòng)我國(guó)生物信息學(xué)特別是單細(xì)胞測(cè)序的發(fā)展，提高從業(yè)人員的技術(shù)水平，由中科成創(chuàng)（北京）生物技術(shù)有限公司舉辦“10X Genomics單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及多組學(xué)數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)培訓(xùn)班”具體事宜通知如下：
一、培訓(xùn)目標(biāo)及特點(diǎn)：
本培訓(xùn)以單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用與數(shù)據(jù)分析、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組、多組學(xué)整合分析和結(jié)果解讀為主題，精心設(shè)計(jì)了具有前沿性、實(shí)用性和針對(duì)性強(qiáng)的理論課程和上機(jī)課程。培訓(xùn)邀請(qǐng)的主講人均是有理論和實(shí)際研究經(jīng)驗(yàn)的人員。學(xué)員通過(guò)與專(zhuān)家直接交流，能夠分享到這些頂尖學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)的研究經(jīng)驗(yàn)和實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)思路。學(xué)員通過(guò)集中專(zhuān)題學(xué)習(xí)后能夠擴(kuò)展思路，在研究技術(shù)方面領(lǐng)悟更多。
二、培訓(xùn)對(duì)象：
大中專(zhuān)院校生物信息、生物計(jì)算、生命科學(xué)、醫(yī)學(xué)、化學(xué)、農(nóng)學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)、數(shù)學(xué)類(lèi)專(zhuān)業(yè)的課程負(fù)責(zé)人、一線教師、教研室骨干人員、教學(xué)管理人員；科研單位從事生物、生命科學(xué)、微生物研究的相關(guān)人員；生物、醫(yī)藥、化學(xué)及相關(guān)企業(yè)的領(lǐng)導(dǎo)與技術(shù)骨干。
三、時(shí)間地點(diǎn)： 2020年12月10日——10月13日 江蘇 南京
（時(shí)間安排：第1天報(bào)到，授課3天）
四、授課專(zhuān)家：
主講專(zhuān)家來(lái)自中科院科研機(jī)構(gòu)的高級(jí)專(zhuān)家，擁有豐富的科研工作經(jīng)驗(yàn)，長(zhǎng)期從事生物信息學(xué)方面的項(xiàng)目研究，發(fā)表Nature, Nature Cell Biology, Molecular Cell等雜志40多篇。具有資深的技術(shù)底蘊(yùn)和專(zhuān)業(yè)背景，目前承擔(dān)國(guó)家科技部、國(guó)家自然基金委和市科技新星項(xiàng)目等多項(xiàng)課題。
五丶培訓(xùn)內(nèi)容：
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單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)與應(yīng)用 |
1. 單細(xì)胞組學(xué)技術(shù)發(fā)展歷程和原理介紹。 2. 單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)在科研領(lǐng)域的應(yīng)用。 3. 近年單細(xì)胞方向高分文章思路解析。 4. 單細(xì)胞組學(xué)和多組學(xué)整合分析思路和案例介紹。 |
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R語(yǔ)言入門(mén)與實(shí)操 |
1. R語(yǔ)言簡(jiǎn)介及安裝，RStudio的安裝及使用說(shuō)明。 2. R語(yǔ)言語(yǔ)法介紹及常用命令。 3. 數(shù)據(jù)處理功能及統(tǒng)計(jì)應(yīng)用。 4. R語(yǔ)言畫(huà)圖實(shí)操。 |
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析思路及流程 |
1. 單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)處理、建庫(kù)及測(cè)序。 2. 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組比對(duì)、定量、分群及擬時(shí)間分析等分析思路。 3. 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組轉(zhuǎn)錄因子及功能通路解析。 4. 單細(xì)胞組學(xué)技術(shù)在癌癥、發(fā)育、免疫及在植物、微生物等領(lǐng)域的研究?jī)?nèi)容及思路。 |
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析實(shí)操 |
1. 常規(guī)單細(xì)胞組學(xué)數(shù)據(jù)比對(duì)。 2. 10X官方單細(xì)胞軟件Cellranger講解及實(shí)操。 3. 從基因表達(dá)矩陣開(kāi)始到marker基因篩選全過(guò)程講解及實(shí)操。 4. 通過(guò)Seurat軟件進(jìn)行PCA及tSNE降維。 5. 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組細(xì)胞鑒定及聚類(lèi)分析。 6. 通過(guò)Seurat及GSVA等進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組差異分析。 |
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多組學(xué)整合分析和結(jié)果解讀 |
1. 轉(zhuǎn)錄組，基因組，表觀分析介紹。 2. RNA和 ATAC-seq等多組學(xué)整合分析。 3. 常規(guī)10X單細(xì)胞ATAC數(shù)據(jù)測(cè)序原理簡(jiǎn)介、分析流程介紹。 4. 單細(xì)胞免疫組庫(kù)測(cè)序技術(shù)及應(yīng)用。 5. 組學(xué)分析常用數(shù)據(jù)庫(kù)介紹及使用。 |
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組軌跡、通路、轉(zhuǎn)錄因子等分析及繪圖實(shí)操 |
1. 通過(guò)Monocle軟件進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組擬時(shí)間分析。 2. 通過(guò)DAVID及metascape網(wǎng)站進(jìn)行通路富集分析。 3. 通過(guò)SCENIC軟件進(jìn)行轉(zhuǎn)錄因子預(yù)測(cè)分析。 4. tSNE，小提琴圖，熱圖，網(wǎng)絡(luò)圖，GO、KEGG富集圖，GSEA等圖形繪制。 |
六、報(bào)名辦法及費(fèi)用：
每人￥4300元（含報(bào)名費(fèi)、培訓(xùn)費(fèi)、資料費(fèi)、上機(jī)費(fèi)）
團(tuán)隊(duì)報(bào)名：3+1優(yōu)惠。（4位學(xué)員其中1位免除費(fèi)用）
上課所有使用軟件與課件資料均可拷貝。
食宿可統(tǒng)一安排，費(fèi)用自理。各單位人員報(bào)名參加，報(bào)名回執(zhí)表請(qǐng)回傳至?xí)⻊?wù)處即可。
如單位有內(nèi)訓(xùn)需求，請(qǐng)將內(nèi)訓(xùn)方案?jìng)髦習(xí)⻊?wù)組，根據(jù)單位需求安排相應(yīng)專(zhuān)家進(jìn)行授課
七、 聯(lián)系方式：
聯(lián)系人：張琦 177 4456 9660
報(bào)名郵箱：zkcc_BIS@vip.163.com
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