醫(yī)學(xué)會議中心

發(fā)布醫(yī)學(xué)會議通知

轉(zhuǎn)錄組學(xué)與全基因組重測序數(shù)據(jù)分析實操班

會議日期 2019-12-26至 2019-12-29
會議地點 河南鄭州
會議學(xué)科 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)其他
主辦單位 中科成創(chuàng)(北京)生物技術(shù)有限公司
學(xué)分情況

轉(zhuǎn)錄組學(xué)與全基因組重測序數(shù)據(jù)分析實操班”通知

各科研單位:

隨著新一代高通量測序技術(shù)的快速發(fā)展,在準(zhǔn)確度大大提高的前提下, 進一步降低測序成本。由此不斷產(chǎn)生出巨量的分子生物學(xué)數(shù)據(jù),這些數(shù)據(jù)有著數(shù)量巨大、關(guān)系復(fù)雜的特點,以至于不利用計算機根本無法實現(xiàn)數(shù)據(jù)的存儲和分析。隨著生物信息學(xué)作為新興學(xué)科迅速蓬勃發(fā)展,正在改變?nèi)藗冄芯可镝t(yī)學(xué)的傳統(tǒng)方式,高通量測序技術(shù)以及數(shù)據(jù)分析技術(shù)已成為探索生物學(xué)底層機制和研究人類復(fù)雜疾病診斷、治療及預(yù)后的重要工具,廣泛應(yīng)用于生命科學(xué)各個領(lǐng)域,是21世紀(jì)生命科學(xué)與生物技術(shù)的重要戰(zhàn)略前沿和主要突破口。為進一步推動我國生物信息學(xué)特別是基因組學(xué)的發(fā)展,提高從業(yè)人員的技術(shù)水平。由中科成創(chuàng)(北京)生物技術(shù)有限公司具體承辦,具體事宜通知如下:

一、培訓(xùn)目標(biāo)及特點:

本培訓(xùn)以轉(zhuǎn)錄組學(xué)與基因組學(xué)的應(yīng)用與數(shù)據(jù)分析為主題,精心設(shè)計了具有前沿性、實用性和針對性強的理論課程和上機課程。培訓(xùn)邀請的主講人均是有理論和實際研究經(jīng)驗的人員。學(xué)員通過與專家直接交流,能夠分享到這些學(xué)術(shù)機構(gòu)的研究經(jīng)驗和實驗設(shè)計思路。學(xué)員通過集中專題學(xué)習(xí)后能夠擴展思路,在研究技術(shù)方面領(lǐng)悟更多。

二、授課專家:

主講專家來自中科院科研機構(gòu)的專家,擁有豐富的科研工作經(jīng)驗,長期從事生物信息學(xué)方面的項目研究,發(fā)表Nature, Nature Cell Biology, Molecular Cell等雜志40多篇。具有技術(shù)底蘊和專業(yè)背景,目前承擔(dān)國家科技部、國家自然基金委和市科技新星項目等多項課題。

三、培訓(xùn)對象:

大中專院校生物信息、生物計算、生命科學(xué)、醫(yī)學(xué)、化學(xué)、農(nóng)學(xué)、計算機科學(xué)、數(shù)學(xué)類專業(yè)的課程負(fù)責(zé)人、一線教師、教研室骨干人員、教學(xué)管理人員;科研單位從事數(shù)據(jù)分析實驗室人員、生物、生命科學(xué)、微生物研究的相關(guān)人員;生物、醫(yī)藥、化學(xué)及相關(guān)企業(yè)的領(lǐng)導(dǎo)與技術(shù)骨干。

四、時間地點:        2019年12月26日——12月29日   河南  鄭州

                       (時間安排:第1天報到,授課3天)

五、培訓(xùn)內(nèi)容:

第一天

9:00-12:00

Lunix系統(tǒng)講解

R語言

1.常規(guī)基礎(chǔ)Linux命令入門講解及實操訓(xùn)練。

2.R語言簡介及安裝,RStudio的安裝及使用說明。

3.R語言語法介紹及常用命令。

4.R語言畫圖實操,tSNE,小提琴圖,熱圖,網(wǎng)絡(luò)圖,GO、KEGG富集圖等圖形繪制(實操)。

13:30-17:30

轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)分析在植物、動物、農(nóng)學(xué)、醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域的應(yīng)用理論講解

1.轉(zhuǎn)錄組技術(shù)發(fā)展前沿動態(tài)。

2.轉(zhuǎn)錄組應(yīng)用案例。

3.轉(zhuǎn)錄組分析應(yīng)用熱點。

第二天

9:00-12:00

轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析流程及實操

1.轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)準(zhǔn)備和軟件介紹。

2.轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化。

3.轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)比對。

4.DESeq2進行表達量估計和分析(實操)。

13:30-17:30

轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)挖掘和關(guān)聯(lián)分析上機實操

1. 轉(zhuǎn)錄組聚類分析(實操)。

2.通過ggsurvival構(gòu)建生存曲線(實操)。

3.通過cox分析構(gòu)建預(yù)后模型(實操)。

4.lncRNA與mRNA關(guān)聯(lián)分析。

5.個性化分析方案。

第三天

9:00-12:00

基因組學(xué)學(xué)數(shù)據(jù)分析在植物、動物、農(nóng)學(xué)、醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域的應(yīng)用及上機操作

1. 基因組學(xué)生物信息學(xué)前沿技術(shù)動態(tài)

2. 基因組重測序及數(shù)據(jù)分析

3. 數(shù)據(jù)模擬(實操)

4. 數(shù)據(jù)過濾及質(zhì)量評估(實操)

5. SOAP/Bwa/Bowtie 等軟件的使用

13:30-17:30

單細(xì)胞測序技術(shù)應(yīng)用與案例介紹、10×單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析思路及流程

1. 單細(xì)胞組學(xué)技術(shù)原理和科研應(yīng)用。

2. 近年單細(xì)胞方向高分文章思路解析和案例介紹。

3. 10×官方單細(xì)胞軟件Cell ranger講解及實操。

4. 從基因表達矩陣開始到marker基因篩選全過程講解及實操。

5. 通過Seurat軟件進行PCA及tSNE降維。

(*實際授課還會增加一些學(xué)員報名時反饋的感興趣內(nèi)容,希望參會人員可以把自己想了解的內(nèi)容,報名時一起填寫在回執(zhí)表上。大家在上課期間有什么問題,都可以隨時提出,如果有針對性問題可在 課間、課下和老師進行交流;)

六、報名辦法及費用: 

每人¥3980元(含報名費、培訓(xùn)費、資料費、上機費)

團隊報名:4+1優(yōu)惠。(5位其中1位免除費用)

食宿可統(tǒng)一安排,費用自理。各單位人員報名參加,報名回執(zhí)表請回傳至?xí)⻊?wù)處即可。

如單位有內(nèi)訓(xùn)需求,請將內(nèi)訓(xùn)方案傳至?xí)⻊?wù)組,根據(jù)單位需求安排相應(yīng)專家進行授課

七、聯(lián)系方式:   

聯(lián)系人:白嵐    138 1194 3959(微信)

郵箱:zkcc_BIS@vip.163.com

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