| 會(huì)議日期 | 2019-09-27至 2019-09-30 |
| 會(huì)議地點(diǎn) | 四川成都 |
| 會(huì)議學(xué)科 | 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)分子生物 |
| 主辦單位 | 中科成創(chuàng)（北京）生物技術(shù)有限公司 |
| 學(xué)分情況 | 無(wú) |
關(guān)于舉辦“表觀遺傳學(xué)及DNA甲基化數(shù)據(jù)分析”專題班通知
各有關(guān)單位:
表觀遺傳學(xué)是研究基因的核苷酸序列不發(fā)生改變的情況下，基因表達(dá)的可遺傳的變化的一門(mén)遺傳學(xué)分支學(xué)科。隨著實(shí)驗(yàn)技術(shù)的進(jìn)步，產(chǎn)生了海量的表觀基因組數(shù)據(jù)，從這些數(shù)據(jù)中挖掘生物學(xué)特征對(duì)理解生命的生理及病理過(guò)程有重要意義。面對(duì)海量的數(shù)據(jù)包括DNA甲基化譜、組蛋白修飾譜、核小體定位信息，研究人員開(kāi)發(fā)了針對(duì)不同數(shù)據(jù)的分析工具和策略，理解和掌握表觀基因組數(shù)據(jù)的分析方法，為推動(dòng)表觀遺傳學(xué)在各學(xué)科領(lǐng)域應(yīng)用及發(fā)展，更好地促進(jìn)專家學(xué)者們?cè)谘芯恐械姆窒砗徒涣�，由中科成�?chuàng)（北京）生物技術(shù)有限公司舉辦“表觀遺傳學(xué)及DNA甲基化數(shù)據(jù)分析”專題班，具體事宜通知如下：
一、培訓(xùn)目標(biāo)及特點(diǎn)：
通過(guò)理論和實(shí)踐有機(jī)的相結(jié)合，對(duì)表觀遺傳學(xué)基本理論和基本技術(shù)的講解，使學(xué)員們深入了解DNA甲基化、組蛋白修飾、非編碼RNA等的知識(shí)以及相關(guān)的數(shù)據(jù)產(chǎn)生的各種高通量實(shí)驗(yàn)技術(shù)與數(shù)據(jù)挖掘。
二、培訓(xùn)對(duì)象：
大中專院校生物信息、生物計(jì)算、生命科學(xué)、醫(yī)學(xué)、化學(xué)、農(nóng)學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)、數(shù)學(xué)類專業(yè)的課程負(fù)責(zé)人、一線教師、教研室骨干人員、教學(xué)管理人員；科研單位從事表觀遺傳學(xué)、DNA甲基化、組蛋白修飾等方面數(shù)據(jù)分析的技術(shù)人員領(lǐng)導(dǎo)與技術(shù)骨干。
三、時(shí)間地點(diǎn)： 2019年9月27日——9月30日 四川 成都
（時(shí)間安排：第1天報(bào)到，授課3天）
四、培訓(xùn)內(nèi)容：
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第一天上午 |
表觀遺傳學(xué)研究?jī)?nèi)容及思路，DNA甲基化原理、應(yīng)用及研究 |
1. 表觀遺傳學(xué)研究?jī)?nèi)容及調(diào)控機(jī)制。 2. 通過(guò)近期Cell文章掌握表觀多組學(xué)研究思路。 3. 高通量測(cè)序技術(shù)概述。 4. 表觀遺傳學(xué)各組學(xué)測(cè)序技術(shù)及分析內(nèi)容。 5. DNA甲基化理論：作用機(jī)制及研究應(yīng)用。 |
理論 |
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第一天下午 |
Linux及R語(yǔ)言實(shí)操，DNA甲基化數(shù)據(jù)分析 |
1. 常規(guī)基礎(chǔ)Linux命令入門(mén)講解及實(shí)操訓(xùn)練。 2. R語(yǔ)言簡(jiǎn)介及安裝，RStudio的安裝及使用說(shuō)明。 3. R語(yǔ)言語(yǔ)法介紹及常用命令。 4. DNA甲基化測(cè)序數(shù)據(jù)分析（bismark，methylKit等軟件）。 5. DNA甲基化芯片數(shù)據(jù)分析（IMA等軟件）。 |
實(shí)操 |
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第二天上午 |
組蛋白修飾及ATAC測(cè)序技術(shù)、分析思路及流程 |
1. 組蛋白修飾的研究方法及技術(shù)發(fā)展。 2. 組蛋白修飾的研究?jī)?nèi)容及科研思路。 3. 組蛋白修飾數(shù)據(jù)的分析流程及繪圖。 4. 組蛋白和多組學(xué)數(shù)據(jù)的整合分析。 |
理論 |
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第二天下午 |
組蛋白修飾及ATAC數(shù)據(jù)分析 |
1. 利用fastqc、cutadapt及Trimmomatic對(duì)原始數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)控。 2. 通過(guò)bowtie2、bwa等軟件進(jìn)行基因組mapping。 3. 通過(guò)MACS2軟件進(jìn)行peak calling。 4. 利用HOMER軟件進(jìn)行peak注釋及motif分析。 5. 調(diào)用R語(yǔ)言包Diffbind進(jìn)行差異peaks分析。 |
實(shí)操 |
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第三天上午 |
非編碼RNA、表觀轉(zhuǎn)錄組研究?jī)?nèi)容及思路 |
1. 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析內(nèi)容及思路介紹。 2. 長(zhǎng)非編碼RNA、microRNA及circRNA的研究方法及思路。 3. 轉(zhuǎn)錄組多組學(xué)整合分析思路和案例介紹。 4. 表觀轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究?jī)?nèi)容及多組學(xué)整合思路。 5. 組學(xué)分析常用數(shù)據(jù)庫(kù)介紹及使用。 |
理論 |
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第三天下午 |
mRNA及非編碼轉(zhuǎn)錄組分析：定量、差異、功能富集及網(wǎng)絡(luò) |
1. 通過(guò)tophat2、hisat2軟件進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)mapping。 2. 通過(guò)HTSeq及featureCounts進(jìn)行基因表達(dá)定量。 3. 通過(guò)Deseq2，edgeR等R語(yǔ)言包進(jìn)行差異表達(dá)分析。 4. 應(yīng)用DAVID及metascape網(wǎng)站進(jìn)行通路富集分析。 5. 箱型圖，熱圖，網(wǎng)絡(luò)圖，GO、KEGG富集圖，GSEA等圖形繪制。 |
實(shí)操 |
五、報(bào)名辦法及費(fèi)用：
每人￥3980元（含報(bào)名費(fèi)、培訓(xùn)費(fèi)、資料費(fèi)、上機(jī)費(fèi)等）
團(tuán)隊(duì)報(bào)名：4+1優(yōu)惠。（5位其中1位免除費(fèi)用）
所報(bào)名參加學(xué)員贈(zèng)送一個(gè)8G U盤(pán)（內(nèi)含上課所有使用軟件與課件資料）
食宿可統(tǒng)一安排，費(fèi)用自理。各單位人員報(bào)名參加，報(bào)名回執(zhí)表請(qǐng)回傳至?xí)⻊?wù)處即可。
如單位有內(nèi)訓(xùn)需求，請(qǐng)將內(nèi)訓(xùn)方案?jìng)髦習(xí)⻊?wù)組，根據(jù)單位需求安排相應(yīng)專家進(jìn)行授課
六、 聯(lián)系方式：
聯(lián)系人：白嵐老師 138 1194 3959
報(bào)名郵箱：zkcc_BIS@vip.163.com
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