江西中醫(yī)學院藥理學重點學科，由藥學院中藥藥理教研室、基礎醫(yī)學院藥理教研室和江西中醫(yī)學院藥物研究所合并組成的，2003年新增為藥理學碩士點。藥理學科組在國家財政部的大力資助下，建立了“中藥藥性研究平臺”；依托國家固體制劑工程中心和江西省清潔級大小鼠生產(chǎn)基地，建立了“中藥新藥藥效與安全評價室”；依托國家教育部中藥制劑重點實驗室醫(yī)學|教育網(wǎng)搜集整理，構建了“藥物代謝研究平臺”，這些平臺建設為藥理重點學科各項工作的順利開展提供了堅強有力的保障。2005年以本學科人員為主要骨干成立了江西省藥理學會，為整體提高我校及江西省的藥理學研究提供了學術溝通渠道。長期以來，本學科點一直是我院的優(yōu)勢學科之一。學科奠基人之一陳奇教授，是全國優(yōu)秀教師，其主編的《中藥藥理實驗》是我國第一部中藥藥理學方法學專著，獲全國普通高校優(yōu)秀教材獎，主編的《中藥藥理研究方法學》獲國家科技進步三等獎、國家圖書獎和全國優(yōu)秀科技圖書一等獎，是目前我國高等醫(yī)藥院校博士生、碩士生教學和科研用書。藥理學課程是江西省首批（1998年）省級優(yōu)質課程，黃敬耀教授主編的21世紀課程教材《藥理學》獲全國高等學校醫(yī)藥優(yōu)秀教材三等獎。