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明確診斷口腔念珠菌病，除依靠病史和臨床表現(xiàn)外，還需要實驗室檢查證實損害組織中存在病原菌。念珠菌實驗室檢測方法包括涂片法、分離培養(yǎng)、組織病理學(xué)檢查、免疫學(xué)和基因診斷等。一般來說，臨床上常用的方法是前三種。
基因診斷近年來，分子水平的研究使得對念珠菌的認(rèn)識突破表型鑒定的局限醫(yī)學(xué)教|育網(wǎng)搜集整理，應(yīng)用基因分型方法對念珠菌進(jìn)行種間鑒別和種內(nèi)分型，為臨床診斷和流行病學(xué)研究提供了更能反映物種本質(zhì)的工具。
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